一是工業(yè)廢棄物污染農(nóng)田、水源和大氣，導(dǎo)致有害物質(zhì)在農(nóng)產(chǎn)品中聚積；
二是隨著農(nóng)業(yè)產(chǎn)品使用量的增加，一些有害的化學(xué)物質(zhì)殘留在農(nóng)產(chǎn)品中；
三是食品生產(chǎn)、加工過(guò)程中，一些化學(xué)色素、化學(xué)添加劑的不適當(dāng)使用，使食品中有害物質(zhì)增加；
四是貯存、加工不當(dāng)導(dǎo)致的微生物污染。
食品受污染主要有這幾方面：
細(xì)菌性污染。這是涉及面廣、影響大、問(wèn)題多的一種污染，大部分食品衛(wèi)生問(wèn)題是由于生物因素引起的。生物性污染主要的是致病性細(xì)菌問(wèn)題，主要包括沙門(mén)氏菌、金黃色葡萄球菌、肉毒桿菌、大腸桿菌0157、李斯特氏菌等。
真菌毒素污染。真菌廣泛存在于自然界中，其產(chǎn)生的毒素致病性強(qiáng)，此外真菌還廣泛用于食品工業(yè)，新菌種的使用、菌種的變異、已使用的菌種是否產(chǎn)毒等問(wèn)題，都應(yīng)引起重視，如黃曲霉可產(chǎn)生黃曲霉毒素，米曲霉可產(chǎn)生３－硝基丙酸、曲酸、圓弧偶氮酸等。
寄生蟲(chóng)。生吃水產(chǎn)品甚至一些其它動(dòng)物肉類(lèi)的行為在部分地區(qū)較普遍，使人們患寄生蟲(chóng)病的危險(xiǎn)性大為增加，部分地區(qū)的食物源性寄生蟲(chóng)發(fā)病率也逐年增加。
農(nóng)藥污染。隨著高效、低毒、低殘留農(nóng)藥的研制和一些高毒高殘留農(nóng)藥禁止使用，農(nóng)藥在食品中的殘留問(wèn)題也將得到改善，但由于氯類(lèi)農(nóng)藥的特點(diǎn)，今后一段時(shí)間內(nèi)這類(lèi)農(nóng)藥的污染問(wèn)題仍不可忽視。此外，獸藥和植物激素在食品中的殘留成為食品污染的新焦點(diǎn)。
重金屬污染。隨著環(huán)保意識(shí)的提高及對(duì)環(huán)境污染的控制，重金屬污染問(wèn)題雖然得到逐步改善，但在短時(shí)間內(nèi)使食品中的重金屬污染降至先進(jìn)水平，還需進(jìn)一步努力。
其它化學(xué)物污染。目前，直接應(yīng)用于食品的化學(xué)物質(zhì)（如食品添加劑）以及間接與食品接觸的化學(xué)物質(zhì)（如農(nóng)藥及污染物）日益增多。銷(xiāo)售的化學(xué)物質(zhì)已達(dá)5萬(wàn)多種，其中食品添加劑估計(jì)有上千種。人類(lèi)長(zhǎng)期接觸這些化學(xué)物質(zhì)后可能引起的毒性（包括致畸、致癌等）反應(yīng)。由于材料工業(yè)的迅速發(fā)展，食品容器、包裝材料帶來(lái)的食品污染問(wèn)題也應(yīng)引起重視。
防止食品污染，不僅要注意飲食衛(wèi)生，還要從各個(gè)細(xì)節(jié)著手．只有這樣，才能從根本上解決問(wèn)題．食品污染的防制措施主要有：
（1）開(kāi)展衛(wèi)生宣傳教育；
（2）食品生產(chǎn)經(jīng)營(yíng)單位要全面貫徹執(zhí)行食品衛(wèi)生法律和國(guó)家衛(wèi)生標(biāo)準(zhǔn)；
（3）食品衛(wèi)生監(jiān)督機(jī)構(gòu)要加強(qiáng)食品衛(wèi)生監(jiān)督，把住食品生產(chǎn)、出廠、出售、出口、進(jìn)口等衛(wèi)生質(zhì)量關(guān)；冠宇儀器本著秉承“重合同、守信用、服務(wù)、互利雙贏”的經(jīng)營(yíng)理念為核心，以產(chǎn)品技術(shù)創(chuàng)新為依托、保障食品、藥品、環(huán)境、水質(zhì)安全為己任 ，同時(shí)為食藥監(jiān)系統(tǒng)、農(nóng)業(yè)系統(tǒng)、畜牧系統(tǒng)、漁業(yè)系統(tǒng)、食品企業(yè)等提供專(zhuān)業(yè)的檢測(cè)產(chǎn)品、技術(shù)支持和高效的整體解決方案。
（4）加強(qiáng)農(nóng)藥管理；
（5）災(zāi)區(qū)要特別加強(qiáng)食品運(yùn)輸，貯存過(guò)程中的管理，防止各種食品意外污染事故的發(fā)生。